予定申告（中間申告）の納税を、紙の納付書で納付するのではなく、ネット経由で納付（電子納税）する方法を一覧にして整理します。
説明のポイント
- 予定申告（中間申告）をネットで納税する方法を紹介している
- 国税は、税務署から送付されてきた納付書からペイジーによる納付がおすすめ。e-Taxのメッセージボックスにアクセスできるならば「お知らせ参照作成」もおすすめ。
- 地方税は、PCdeskから「みなし納付」で納付するのがおすすめ
決算に比べ、予定申告は会社で処理することも多い
決算の申告では、会計事務所が関与することが多く、その納付も会計事務所から案内することが多いと考えられます。
これに比べ、決算から半年後の「予定申告」（中間申告ともいう）の納付では、納付書が会社に直接送付され、納税も会社で済ませることが多いといえます。
納付書が送付されてくるため、どうしても紙ベースの処理が残りがちです。
これを「ネットで納付する方法はあるか？」という視点から、現時点（初出2020年、最終改訂2024年）の最新状況を踏まえて整理しました。
予定申告をネットで納付する方法（国税）
1．納付書に記載のペイジーのコードを利用（おすすめ）
一番楽なのは、納付書のペイジーのコードを使って、納付することです。ペイジーとは、インターネットバンキングで電子納付できるシステムのことです。
ペイジーは、下のロゴが納付書にある場合、ペイジーで納付可能なものであることを意味します。
国税から送られてくる中間納付では、ペイジーのコードが付与されています。国税以外にも、社会保険料の納付をペイジーで支払っている会社もあるでしょう。
税務署から届く納付書については、ペイジーのコードは、納付書の左下に印字されています。
このペイジーを利用するには、金融機関のインターネットバンキング契約が必要です（※ネット納付ではありませんが、ATMでペイジーを利用できる場合もあります）。ペイジーを利用できる金融機関は、こちらのペイジー公式サイトで検索できます。
また、ペイジーの納付にあたっては、e-Taxの「納税用確認番号」（6桁の数字）が必要です。
この番号は、e-TaxのID（利用者識別番号）を取得した時点で同時に登録しています。この番号がわからない場合で、IDを最初に取得したのが会計事務所であるならば、会計事務所に確認番号をお尋ねください。
2．クレジットカード納付
国税のクレジットカード納付は、2017年から始まった納付方法です。
クレジットカードがあれば、それ以外の前準備は不要です。この納付方法は、予定申告（中間申告）でも対応しています。ただし、決済手数料がかかることに注意です。
納付金額に上限があり、1,000万円未満の場合で対応しています。これを上回る場合、複数回に分割して納付することも可能です。
また、法人の納税でも、社長個人名義のクレジットカードで納付してもかまいません。納付したあとで、社長あてに経費精算をすればよいでしょう。
3．e-Taxソフト（WEB版）のメッセージボックスに届いた「お知らせ」から納付情報を作成する（おすすめ）
2024年5月、e-Taxのメッセージボックスに届く中間申告の「お知らせ」の画面から、納付情報登録依頼の参照作成ができるようになりました。
この参照作成では、納付情報登録依頼の作成にあたり、納付情報が自動で転記されますので、利便性が大幅に高まりました。これはe-Taxソフト（WEB版）で利用できる機能です。
お知らせ参照作成の利用方法については、e-Taxホームページにあるマニュアルをご覧ください→（参考１）お知らせからの納付情報登録依頼の作成（お知らせ参照作成）
4．e-Taxで納付情報登録依頼を送信後に納付
e-Taxの操作で「納付情報登録依頼」を利用することで、電子納税の手続きをすることができます。
上記3の「お知らせ参照作成」が用意されていなかった時代では、こちらの方法で数字を手入力していました。現在も可能な方法ですが、上記3の「お知らせ参照作成」をおすすめします。
作成した納付情報にしたがって、インターネットバンキングや、ダイレクト納付を利用すればよいでしょう。ペイジーのコードを作ることもできます。
納付情報に「予定申告」の表示はありませんので、「中間申告」で送信します。
納付情報登録依頼を活用する方法としては、次のケースが考えられます。
- 会社はe-Taxを利用していないが、インターネットバンキングは利用している。会計事務所の担当者が「納付情報」を作成して、ペイジーのコードを会社に伝達し、会社にてインターネットバンキングでペイジーで納付
- 会社はe-Taxを利用していない。会計事務所の担当者が「納付情報」を作成して、会社の承認にもとにダイレクト納付で代行処理
- なんらかの理由で、中間納付の納付書が税務署から届かなかった。（ペイジーのコードは「納付情報登録依頼」で作成できる）
参考（いずれも国税庁サイト）
5．ダイレクト納付の予納を併用する
2019年から利用できるようになった「ダイレクト納付の予納」（予納ダイレクト）の機能を利用し、予納と中間申告分をセットで納付する方法もあります。
「ダイレクト納付の予納」は、「e-Taxソフト（WEB版）」で設定できます。「e-Taxソフト（WEB版）」を利用するには、e-TaxのIDが必要です。
注意点としては、「ダイレクト納付の予納」を利用して中間申告分も納税するためには、少額でも「予納」が必須となるということです。
微妙に不便ですが、中間申告分だけを単独で利用することはできません。
6．予定申告書を提出してから電子納税
e-Taxで法人の確定申告を行っている場合、予定申告（中間申告）に関して「お知らせ」がメッセージボックスに届きます。
このメッセージボックスに届いた「お知らせ」を経由して、予定申告書を作成・提出し、その後に電子納税を行うことが可能です。
ただし、これはインストール型の「e-Taxソフト」限定機能のようです。（※WEB版には同種の機能なし）
自社で予定申告書を作成・提出する場合、会計事務所とe-TaxのID（利用者識別番号）の共有が必要です。
「お知らせ」を経由しない場合は、インストール型の「e-Taxソフト」を用いて、法人税の申告から「予定申告（別表18）」を作成して送信します。送信には電子証明書が必要ですので、社長のマイナンバーカードなどを用意します。
送信後の納税では、インターネットバンキング、ダイレクト納付のどちらかで電子納税できます。
予定申告書の提出方法は、以下の資料を参考にしてください。
参考（いずれも国税庁サイト）
- （マニュアル）「メッセージボックスのお知らせ内容から法人税予定申告書・消費税中間申告書が作成できます！」
- 予定（中間）申告書用紙の送付に係るお知らせ
- 申告案内や予定納税額等を表示したお知らせの変更について
予定申告をネットで納付する方法（地方税）
地方税では、2019年10月の「地方税共通納税システム」の稼働により、電子納税の環境が改善しました。
自治体ごとに対応がまちまちだったのが、全国一律で電子納税に対応できるようになっています。
1．PCdeskの「みなし納付」から電子納税（おすすめ）
PCdeskの納税画面から「みなし納付」を選択し、納税額を入力して納付する方法です。
PCdeskとは、eLTAX（地方税の電子申告ネットワーク）が提供する公式の税務ソフトです。無料で利用することができます。
利用IDとパスワードは、会計事務所が取得済みの可能性が高いので、会社の担当者は会計事務所に事前に確認します。
PCdeskの利用方法ですが、納付情報発行依頼で「みなし納付」を選択し、そこから納付手続をします。予定納税の方法として、最も楽と考えられます。税額は自分で入力する必要があります。
eLTAXを経由しての納税であるため、インターネットバンキング納付、クレジットカード納付（2023年4月対応済み）、ダイレクト納付のいずれにも対応しています。
なお、「みなし納付」の用語の意味については、eLTAXホームページの「よくあるご質問」をご参照ください。（→Q.「みなし納付」とはなんですか。また、その手続き方法を教えてください。）
2．予定申告書を提出してから電子納税
予定申告をeLTAXで送信し、その後、申告書に記載のある納税額をインターネットバンキング、またはダイレクト納付で納税できます。
会社で予定申告書を送信するためには、PCdesk（DL版）をインストールし、「予定申告書」を作成して送信します。送信には電子証明書が必要です。
これは、国税の「5．予定申告書を提出してから電子納税」で紹介した方法と、ほぼ同一です。
なお、プレ申告データが届いていれば、PCdesk(DL版）では、そのデータを引用して転記することが可能です。
ただし、無理に予定申告書を提出せずとも、ほとんどの場合は「1．みなし納付から電子納税」の方法で構わないでしょう。ここでは、あくまで「できる」という意味で紹介しています。
3．予定申告書の提出後にQRコード付き納付書の発行を受ける
地方税の納付書も、国税と同じようにペイジーのコードが書いてあれば簡単なのですが、地方税では対応していないという問題があります。
ペイジーのコードではありませんが、地方税の納付では2023年4月に、納付書に全国共通QRコードが付されるようになりました。このQRコード付きの納付書を受け取り、「地方税お支払サイト」から納付する方法が考えられます。
この場合、まず申告書を提出し、その後でQRコード付きの納付書を発行してもらうことになります。（※納税額が空欄の納付書にはQRコードは付されていませんので、申告書の提出が必要です）
例えば、大阪府「Pay-easy(ペイジー）収納について」によると、
※法人府民税・法人事業税（特別法人事業税又は地方法人特別税を含む）、府民税利子割、府民税配当割、府民税株式等譲渡所得割、ゴルフ場利用税、軽油引取税、宿泊税について、納税義務者（特別徴収義務者）が税額を記入して納税する「複写式の納付書」は、ペイジー納付に対応しておりません。
ただし、申告期限の１週間前までに管轄の府税事務所へ申告書が届いており、納付書の発行依頼があった場合は、「地方税統一QRコード（eL-QR（エルキューアール））」の印刷がある納付書の送付（交付）が可能となります。
とされています。（太字はブログ筆者による）
この方法がすべての自治体で対応可能かはわかりませんので、利用する自治体に確認が必要です。
申告書を提出してから、改めて納付書の発行を受ける手間を考えると、メリットは少ないように思われます。
まとめ
ネットで、予定申告（中間申告）の納税に対応する方法を整理しました。
国税は、納付書に書いてあるペイジーを使えば、素早く納付できそうです。e-Taxのメッセージボックスにアクセスできるならば、お知らせからの参照作成もおすすめです。
地方税については、PCdeskの「みなし納付」を利用する方法がおすすめです。会社の担当者は、eLTAX（PCdesk）の操作に不慣れかもしれませんが、会計事務所に利用方法を相談してもよいでしょう。